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Jun 22, 2023

형광 표적 포획을 통한 기능성 살해 세포의 식별, 분류 및 프로파일링

Nature Biomedical Engineering(2023)이 기사 인용 9 Altmetric Metrics 세부 정보 세포 매개 세포 독성을 평가하기 위한 분석은 주로 표적 세포 중심이며 식별 및 분리할 수 없습니다.

Nature Biomedical Engineering (2023)이 기사 인용

9 알트메트릭

측정항목 세부정보

세포 매개 세포 독성을 평가하기 위한 분석은 주로 표적 세포 중심이며 세포 독성 효과기 세포의 하위 집단을 식별하고 분리할 수 없습니다. 여기서 우리는 공동 배양에서 기능성 킬러 세포 하위 집단의 정확한 식별 및 분류를 위해 유세포 분석과 호환되는 분석법을 설명합니다. 우리가 PAINTKiller('살해 세포의 근접 친화성 세포내 전달 식별')라고 명명한 이 분석은 용해된 세포 독성 세포의 표면에 있는 용해된 세포에 의해 '채색된' 세포내 형광 단백질의 검출에 의존합니다(구체적으로는 세포에서 세포내 플루오레세인 유도체 카르복시플루오레세인 숙신이미딜 에스테르를 용해시키면 범백혈구 표면 수용체 CD45에 대한 항체에 연결된 항-플루오레세인 이소티오시아네이트에 대한 항체에 의해 자연 살해 세포의 표면에 포획됩니다. 이 분석은 세포 독성과 관련된 분자 경로 분석을 위해 단일 세포 RNA 서열 분석과 통합될 수 있으며 기능적 면역 반응의 상관 관계를 밝히는 데 사용될 수 있습니다.

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선별된 특징 유전자 세트는 Molecular Signatures Database(MSigDB, v.7.4)에서 공개적으로 이용 가능합니다. PAINTKiller-seq의 시퀀싱 데이터는 GEO 데이터베이스에서 액세스 번호 GSE207508로 제공됩니다. 이 백서에 설명된 결론을 평가하는 데 필요한 모든 데이터는 백서 및 보충 정보에 포함되어 있습니다. 연구 중에 생성된 원시 및 분석된 데이터 세트는 합당한 요청이 있을 경우 교신 저자가 연구 목적으로 사용할 수 있습니다. 이 문서에는 원본 데이터가 제공됩니다.

그림에 표시된 분석을 재현하기 위한 R 코드는 Zenodo(https://doi.org/10.5281/zenodo.8004120)에서 확인할 수 있습니다.

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